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学校现有国家重点实验室培育基地、国家级实验教学示范中心、国家中医药虚拟仿真实验教学示范中心、中药饮片炮制国家地方联合工程研究中心、国家中药种质资源库（四川）、教育部2011协同创新中心西南道地药材省部共建协同创新中心、教育部重点实验室中药材标准化教育部重点实验室、教育部工程研究中心、国家中医药管理局重点研究室、国家中医药管理局中医药科研实验室（三级）、四川省重点实验室等各级各类实验室74个。

学校现有公共技术平台均可通过大学科技园对外开放，贡献地方中医药产业发展，实现校企双方优势互补、资源共享，推动科研成果转化。历年来，在科学研究、成果转化等方面取得了显著成效。