1927年9月29日，毛泽东同志率领湘赣边界秋收起义部队到达江西永新县三湾村。起义部队到达三湾的时候，人员的流失量很大，剩下不足1000人，思想相当混乱。在当时，基层党组织还没有建立起来，雇佣军队的思想还影响着众多的革命战士，党也不能切实掌握部队的组织力量，最重要的是作战失利、连续行军、不能及时休息，斗争很艰苦，一些人意志不坚定的人就开始出现了思想动摇，趁着晚上夜黑风高就偷偷的逃跑了。为了巩固我们的革命军队，加强党对军队的领导作用，适应革命斗争形势的需要，在到达三湾的当天晚上，毛泽东同志就主持召开了前敌委员会议，决定对起义部队进行整顿和改编。

在三湾改编期间，毛泽东同志创造性地提出了支部建在连上的原则，对实现党对军队的领导奠定了重要的组织基础。三湾改编的另一项重要内容就是在军队内实行民主主义。三湾改编后，军队在连以上设立党代表，担任党组织书记，专做连以上的思想政治工作。这样，党代表制度就使得人民军队中各层级逐步形成了首长分工负责制。

三湾改编是中国共产党建设新型人民军队最早的一次成功探索和实践。从政治上组织上保证了党对军队的绝对领导。在之后的古田会议当中，确立了人民军队建设的基本原则，提出了要把军队建设成为无产阶级领导的新型人民军队。就这样，党对军队绝对领导的根本原则和制度，在以毛泽东为代表的中国共产党人长期革命斗争实践中确立和逐步完善起来了。在新时代条件之下，以习近平同志为核心的党中央坚强领导下，对于党对军队的绝对领导又有了一系列新的认识和发展，标志着党的军事指导理论的与时俱进。